Dönem III’te yatay entegrasyon hastalıklara giriş, hastalıkların patolojisi ve farmakolojik tedavi ajanlarının tanıtılması şeklinde yine sistemsel temelde 6 kurula ayrılarak oluşturulmuştur. 1. kurulda hastalıkların biyolojik temelleri, hücre zedelenmesi ve neoplazi konularını içeren patoloji, farmakoloji dersleri yanında bu konularla ilgili bazı klinik konular işlenmektedir. Hastalıkların tıbbi mikrobiyolojik temeli ve enflamasyon temalı 2. kurulda immün sistem işlevleri ve inflamasyon süreçleriyle bakteri, virüs, mantar ve parazitler ve oluşturdukları hastalıklar ve bu hastalıkların tedavisinde kullanılan ilaçlar anlatılmaktadır. 3. kurulda dolaşım sistemi ve solunum sistemi hastalıklarının kliniği, patolojik özellikleri ve bu hastalıklarda kullanılan ilaçların farmakolojisiyle birlikte, genel anlamda halk sağlığı konuları işlenmektedir. 4. kurulda acil tıp ve ilk yardım, kan hastalıkları ve aile hekimliği ve halk sağlığı yönüyle koruyucu hekimlik konuları anlatılmaktadır. 5. kurul üreme sistemi, sindirim sistemi ve endokrin sistemle ilgili hastalıkların patolojik ve klinik özellikleri ve bu hastalıkların sağaltımında kullanılan ilaçları konu edinmektedir. 6. kurulda, boşaltım sistemi ve sinir sistemi hastalıklarının patolojik ve klinik özellikleri ve bu hastalıkların tedavisinde kullanılan ilaçların farmakolojisini içermektedir.